Skip to contents

SndsTools : Extraction de recours aux soins dans le SNDS avec R

Description

Ce package R permet d’extraire des données de recours aux soins du SNDS (Système National des Données de Santé) pour une population donnée.

Fonctionnalités

Ce package R simplifie les étapes d’extraction de données du SNDS sur des données utilisées dans la majorité des études sur le SNDS. Les principales fonctionnalités couvertes sont les suivantes :

  • Effectuer l’extraction des tables individuelles pour les données suivantes :

    • Consultations dans le DCIR,
    • Médicaments dans le DCIR,
    • Affections de longue durée (ALD),
    • Hospitalisations dans le MCO,
    • Consultations dans le MCO.

  • Intègre les requêtes mois par mois sur la date de flux pour les données DCIR conformément aux recommandations de la CNAM.

  • Intègre les filtres qualités usuels pour exclure les lignes indésirables (ex. PRS_DPN_QLP != 71 pour exclure les remontées pour information dans le DCIR).

Historique

Ce projet a été initié suite à la rencontre de plusieurs utilisateurs du SNDS lors du congrès Emois en mars 2024. Il est actuellement en phase de développement actif.

C’est un projet communautaire, évolutif par nature, qui vise à rassembler les différents utilisateurs du SNDS.

Contexte technique

Données

Les données sont issues du SNDS et sont hébergées sur le portail de l’assurance maladie (CNAM). Pour mener utiliser ce package, il est nécessaire d’avoir un accès aux données individuelles bénéficiaires exhaustives de consommation de soins.

Schéma de flux de données

TODO (figure à mettre dans man/figures)

Technologies

  • Langage de programmation : R
  • Packages utilisés : dplyr, dbplyr, DBI, glue, lubridate, progress

Liens utiles