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Prise en main

Source: vignettes/paresnds.Rmd
paresnds.Rmd

A quoi sert ce paquet R de traitement de données ?

Ce paquet R de traitement de données a pour objectif de faciliter l’accès aux données du Système National des Données de Santé (SNDS) pour les utilisateurs de R. Il permet de simplifier les extractions de données et de mettre à disposition des fonctions implémentants les bonnes pratiques pour utiliser ces données.

Prise en main rapide

Installation

Sur le portail CNAM

Il est nécessaire de copier/coller le code source du paquet sur le portail CNAM. Pour cela, il faut suivre les étapes suivantes :

    1. En local (sur votre ordinateur) : Télécharger le fichier sndsTool.R de la dernière release du paquet disponible sur github. Celui-ci contient toutes les fonctions du paquet.
    1. En local, ouvrir le fichier sndsTool.R et copier tout son contenu.
    1. Sur le portail CNAM, coller le contenu de ce fichier dans un nouveau script R sndsTools.R.
    1. Sur le portail CNAM, charger toutes les fonctions du paquet: source("sndsTools.R")

NB: La version la plus à jour de sndsTools.R (entre deux releases) est disponible comme artifact sur le dépôt GitHub sur la page de l’action. Attention, cette version peut être instable, il est recommandé d’utiliser une release stable du paquet.

En local (pour le développement du paquet uniquement)

Ouvrir le paquet avec Rstudio, puis lancer :

devtools::install(dependencies = TRUE)

Puis pour charger le paquet :