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Extraction des consultations dans le DCIR.

Source: R/extract_consultations_erprsf.R
extract_consultations_erprsf.Rd

Cette fonction permet d'extraire les consultations dans le DCIR. Les consultations dont les dates EXE_SOI_DTD sont comprises entre start_date et end_date (incluses) sont extraites.

Usage

extract_consultations_erprsf(
  start_date,
  end_date,
  pse_spe_filter = NULL,
  prestation_filter = NULL,
  dis_dtd_lag_months = 6,
  patients_ids_filter = NULL,
  output_table_name = NULL,
  conn = NULL
)

Arguments

start_date

Date. La date de début de la période des consultations à extraire.

end_date

Date. La date de fin de la période des consultations à extraire.

pse_spe_filter

Character vector (Optionnel). Les codes spécialités des médecins (référentiel IR_SPE_V) effectuant les consultations à extraire. Si pse_spe_filter n'est pas fourni, les consultations de tous les spécialités sont extraites. Défaut à NULL.

prestation_filter

Character vector (Optionnel). Les codes des prestations à extraire en norme B5 (colonne PRS_NAT_REF, référentiel IR_NAT_V). Si prestation_filter n'est pas fourni, les consultations de tous les prestations sont extraites. Les codes des prestations sont disponibles sur la page "Cibler selon les natures de prestations"(https://documentation-snds.health-data-hub.fr/snds/fiches/ prestation.html) de la documentation SNDS. Défaut à NULL.

dis_dtd_lag_months

Integer (Optionnel). Le nombre maximum de mois de décalage de FLX_DIS_DTD par rapport à EXE_SOI DTD pris en compte pour récupérer les consultations. Défaut à 6 mois.

patients_ids_filter

data frame (Optionnel). Un data frame contenant les paires d'identifiants des patients pour lesquels les consultations doivent être extraites. Les colonnes de ce data frame doivent être BEN_IDT_ANO, BEN_NIR_PSA et BEN_RNG_GEM. Les BEN_NIR_PSA doivent être tous les BEN_NIR_PSA associés aux BEN_IDT_ANO fournis. Défaut à NULL.

output_table_name

Character (Optionnel). Si fourni, les résultats seront sauvegardés dans une table portant ce nom dans la base de données au lieu d'être retournés sous forme de data frame. Si cette table existe déjà, le programme s'arrête avec un message d'erreur. Défaut à NULL.

conn

DBI connection (Optionnel). Une connexion à la base de données Oracle. Par défaut, une connexion est établie avec oracle.

Value

Si output_table_name est NULL, retourne un data frame contenant les consultations. Si output_table_name est fourni, sauvegarde les résultats dans la table spécifiée dans Oracle et retourne NULL de manière invisible. Dans les deux cas les colonnes de la table de sortie sont :

  • BEN_NIR_PSA : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) ne sont pas fournis. Identifiant SNDS, aussi appelé pseudo-NIR.

  • BEN_IDT_ANO : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) sont fournis. Numéro d’inscription au répertoire (NIR) anonymisé.

  • EXE_SOI_DTD : Date de la consultation.

Details

Le décalage de remontée des données est pris en compte en récupérant également les consultations dont les dates FLX_DIS_DTD sont comprises dans les dis_dtd_lag_months mois suivant end_date.

Si patients_ids_filter est fourni, seules les consultations pour les patients dont les identifiants sont dans patients_ids_filter sont extraites. Dans le cas contraire, les consultations de tous les patients sont extraites.

Pour être à flux constant sur l'ensemble des années, il faut utiliser dis_dtd_lag_months = 27 Cela rallonge le temps d'extraction alors que l'impact sur l'extraction est minime car la Cnam estime que 99 % des soins sont remontés à 6 mois c'est-à-dire pour dis_dtd_lag_months = 6.

Un guide sur l'activité des médecins libéraux est disponibles sur la page Activité des médecins libéraux. #nolint

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
dispenses <- extract_consultations_erprsf(
  start_date = as.Date("2010-01-01"),
  end_date = as.Date("2010-01-03"),
  pse_spe_filter = c("0", "00", "36")
)
} # }