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Extraction des consultations dans le DCIR.

Source: R/extract_consultations_erprsf.R
extract_consultations_erprsf.Rd

Cette fonction permet d'extraire les consultations dans le DCIR. Les consultations dont les dates EXE_SOI_DTD sont comprises entre start_date et end_date (incluses) sont extraites.

Usage

extract_consultations_erprsf(
  conn,
  start_date,
  end_date,
  pse_spe_filter = NULL,
  prestation_filter = NULL,
  patients_ids_filter = NULL,
  analyse_couts = FALSE,
  dis_dtd_lag_months = 6,
  sup_columns = NULL
)

Arguments

conn

DBI connection. Une connexion à la base de données Oracle.

start_date

Date. La date de début de la période des consultations à extraire.

end_date

Date. La date de fin de la période des consultations à extraire.

pse_spe_filter

Character vector (Optionnel). Les codes spécialités des médecins (référentiel IR_SPE_V) effectuant les consultations à extraire. Défaut à NULL.

prestation_filter

Character vector (Optionnel). Les codes des prestations à extraire en norme B5 (colonne PRS_NAT_REF, référentiel IR_NAT_V). Défaut à NULL.

patients_ids_filter

data.frame (Optionnel). Un data.frame contenant les paires d'identifiants des patients pour lesquels les consultations doivent être extraites. Les colonnes de ce data.frame doivent être "BEN_IDT_ANO", "BEN_NIR_PSA" et "BEN_RNG_GEM". Les "BEN_NIR_PSA" doivent être tous les "BEN_NIR_PSA" associés aux "BEN_IDT_ANO" fournis. Défaut à NULL.

analyse_couts

Logical (Optionnel). Si TRUE, les filtres de qualité liés aux coûts, écartant les actes en majorations sont ignorés. Utile pour des analyses portant sur les coûts. Défaut à FALSE.

dis_dtd_lag_months

Integer (Optionnel). Le nombre maximum de mois de décalage de FLX_DIS_DTD par rapport à EXE_SOI DTD pris en compte pour récupérer les consultations. Défaut à 6 mois.

sup_columns

Character vector (Optionnel). Les colonnes supplémentaires à ajouter à la table de sortie. Défaut à NULL, donc aucune colonne ajoutée.

Value

Retourne une lazy table contenant les consultations. Les colonnes de la table de sortie sont :

  • BEN_NIR_PSA : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) ne sont pas fournis. Identifiant SNDS, aussi appelé pseudo-NIR.

  • BEN_IDT_ANO : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) sont fournis. Numéro d'inscription au répertoire (NIR) anonymisé.

  • EXE_SOI_DTD : Date de la consultation.

Details

Le décalage de remontée des données est pris en compte en récupérant également les consultations dont les dates FLX_DIS_DTD sont comprises dans les dis_dtd_lag_months mois suivant end_date.

Si patients_ids_filter est fourni, seules les consultations pour les patients dont les identifiants sont dans patients_ids_filter sont extraites. Dans le cas contraire, les consultations de tous les patients sont extraites.

Pour être à flux constant sur l'ensemble des années, il faut utiliser dis_dtd_lag_months = 27 Cela rallonge le temps d'extraction alors que l'impact sur l'extraction est minime car la Cnam estime que 99 % des soins sont remontés à 6 mois, c'est-à-dire pour dis_dtd_lag_months = 6.

See also

Other extract: extract_consultations_mcofcstc(), extract_deaths(), extract_drugs_erphaf(), extract_drugs_erucdf(), extract_ij_erprsf(), extract_longtermdiseases_irimbr(), extract_stays_mcob(), extract_stays_ssr(), snds_codes()

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
start_date <- as.Date("2010-01-01")
end_date <- as.Date("2010-01-03")
conn <- connect_oracle()
consultations <- extract_consultations_erprsf(
 conn = conn,
  start_date = start_date,
  end_date = end_date,
  pse_spe_filter = c("0", "00", "36")
)
} # }