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Extrait les dispensations de médicaments en accès précoces depuis le DCIR.

Source: R/extract_drugs_erucdf.R
extract_drugs_erucdf.Rd

Cette fonction permet d'extraire les dispensations de médicaments en accès précoces réalisés en hospitalisation privée (ex-OQN) ou en rétrocession hospitalière privée et publique (ex-OQN et ex-DGF). Les dispensations dont les dates EXE_SOI_DTD sont comprises entre start_date et end_date (incluses) sont extraites.

Usage

extract_drugs_erucdf(
  conn,
  start_date,
  end_date,
  ucd_codes_filter = NULL,
  patients_ids_filter = NULL,
  dis_dtd_lag_months = 6,
  sup_columns = NULL
)

Arguments

conn

DBI connection. Une connexion à la base de données Oracle.

start_date

Date. La date de début de la période des dispensations à extraire.

end_date

Date. La date de fin de la période des dispensations à extraire.

ucd_codes_filter

Character vector (Optionnel). Les codes UCD des dispensations de médicaments à extraire. Attention, les codes UCD doivent être fournis au format UCD 7 caractères préfixé de 6 zéros : "0000009419723". Ce format est celui utilisé dans la base de données. Si NULL, extrait tous les codes.

patients_ids_filter

data.frame (Optionnel). Un data.frame contenant les paires d'identifiants des patients pour lesquels les délivrances de médicaments doivent être extraites. Les colonnes de ce data.frame doivent être "BEN_IDT_ANO", "BEN_NIR_PSA" et "BEN_RNG_GEM". Les "BEN_NIR_PSA" doivent être tous les "BEN_NIR_PSA" associés aux "BEN_IDT_ANO" fournis. Défaut à NULL.

dis_dtd_lag_months

Integer (Optionnel). Le nombre maximum de mois de décalage de FLX_DIS_DTD par rapport à EXE_SOI_DTD pris en compte pour récupérer les dispensations de médicaments. Défaut à 6 mois.

sup_columns

Character vector (Optionnel). Les colonnes supplémentaires à ajouter à la table de sortie. Défaut à NULL, donc aucune colonne ajoutée.

Value

Retourne une lazy table contenant les dispensations de médicaments en accès précoces. Les colonnes de la table de sortie sont :

  • BEN_NIR_PSA : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) ne sont pas fournis. Identifiant SNDS, aussi appelé pseudo-NIR.

  • BEN_IDT_ANO : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) sont fournis. Numéro d'inscription au répertoire (NIR) anonymisé.

  • BEN_RNG_GEM : Colonne présente uniquement si les identifiants patients (patients_ids_filter) ne sont pas fournis. Rang GEM.

  • EXE_SOI_DTD : Date de la prestation

  • EXE_SOI_DTF : Heure de la prestation

  • PRS_NAT_REF : Code de la nature de la prestation

  • UCD_TOP_UCD : Circuit de délivrance

  • UCD_UCD_COD : Code UCD du médicament

  • UCD_DLV_NBR : Nombre de délivrances

  • Les colonnes supplémentaires spécifiées dans sup_columns si fournies.

Details

Le décalage de remontée des données est pris en compte en récupérant également les dispensations dont les dates FLX_DIS_DTD sont comprises dans les dis_dtd_lag_months mois suivant end_date.

NB: La jointure avec la table établissement est faite avec un inner_join. On ne garde que les AP prescrites en établissement.

See also

Other extract: extract_consultations_erprsf(), extract_consultations_mcofcstc(), extract_deaths(), extract_drugs_erphaf(), extract_ij_erprsf(), extract_longtermdiseases_irimbr(), extract_stays_mcob(), extract_stays_ssr(), snds_codes()

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
start_date <- as.Date("2019-01-01")
end_date <- as.Date("2019-12-31")
ucd_codes <- c("0000009419723")
conn <- connect_oracle()

result <- extract_drugs_erucdf(
  conn = conn,
  start_date = start_date,
  end_date = end_date,
  ucd_codes_filter = ucd_codes
)
} # }